Il Giappone ha inventato una nuova arma, un esoscheletro armato e potenziato chiamato IS: Infinite Stratos, la nuova arma si presto rivelata la migliore in circolazione. Visto che solo le donne possono usare l'IS l'equilibrio di poteri all'interno della societ e molto cambiato e ora le donne sono al comando. Orimura Ichika, un ragazzo 15, l'unico uomo in grado di controllare un IS, quindi viene costretto a iscriversi alla scuola d'addestramento piloti. La sua nuova da pilota e circondato da ragazze appena cominciata...
